CRISPRs found in the submitted sequence(s)

Sequence: F0568

Sequence description :
Length (bp): 2334744

Number of CRISPRs candidates = 9
Confirmed CRISPRs = 7	Questionable CRISPRs = 2
F0568_Crispr_1 F0568_Crispr_2 F0568_Crispr_3 F0568_Crispr_4 F0568_Crispr_7 F0568_Crispr_8 F0568_Crispr_9	F0568_PossibleCrispr_5 F0568_PossibleCrispr_6
CRISPRs candidates localization

Rebuild a CRISPR, modify the DR sequence

Confirmed CRISPRs (7)

CRISPR id : tmp_1_Crispr_1

CRISPR start position : 429639 ---------- CRISPR end position : 429865 ---------- CRISPR length : 226
DR consensus : GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
DR length : 30 Number of spacers : 3

429639	ATTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CGAATGGAAGACCGAGGGGAACCTGTTGTCGAACG	429703
429704	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AAGTAATCTTGAGGCAGGGAGTTGGAGACTTGTCT	429768
429769	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGCTGAAGAACAACCGCCAGCAGTCGGAGGGGTCGC	429834
429835	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT		429865

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_Crispr_2

CRISPR start position : 429968 ---------- CRISPR end position : 432232 ---------- CRISPR length : 2264
DR consensus : GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
DR length : 30 Number of spacers : 34

429968	NTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCGTTCAGGTTTCCCCTTTTGAATTTCAGCACCACCC	430034
430035	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TCCCGCCTTTTCAAGGCGACAACGGGTAACTGCT	430098
430099	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GAACTTGACAAGACGGCAGTGAGTAAGATCAAGAG	430163
430164	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TGAGGCAGGGCGGAAAGCCTGCAAGCGAAACGCCG	430228
430229	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AAAAAAACACACACGATTCGTAGCAACCTTCCCCTG	430294
430295	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CTTTGTTGATAGCGTTTCTGCTTTTAATCTCATGTC	430360
430361	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ATCCGTCATCTCGAGCAGTTTGTACTCGTCGATGA	430425
430426	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CTTGTACCATTTCACTGTCTTCCCGCTGCCCTGCAC	430491
430492	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GAGGGGCGGGACGCCGGTGTAACACTGACGTCCAAA	430557
430558	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCAAGCCTCCACGGTAGCACTGCCCCAAGCCTCCA	430622
430623	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTGGCTAACGAATCTTGAGGACGAATCCTCTTGTCT	430688
430689	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CGACTTCTGTGTAGTCGAATCGATGAGTCCGCCCTGC	430755
430756	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CATAAGAAGAGCGGATCACGCCAACACCGATATCGTG	430822
430823	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TAAAGCAGCTGCCAGCGATTGGGAACCGAGTAGGTGG	430889
430890	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CAGCCCGTGGGCACCCGTCAAGGCCGAGCCCGGCGT	430955
430956	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CCTTGCCGTATTTCAACGCCACCAGCGGCGAAAAAT	431021
431022	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AAATTGTTTGGGCGGACGGTTCTCTCCGCGCTCTTG	431087
431088	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ATTCACTTTGTGGACAAACGTTGTCCTCTCCATCAT	431153
431154	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTGGCGATTTCGCCATAAGTGATATTCTGTTTCCGTC	431220
431221	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AGAAGACGCTCTGAAAGACCACGCTCTTTTGAGCG	431285
431286	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	ATCTTTGGGGCTTAACGCTTCAAAGATAGTCGGCT	431350
431351	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GGTGCCCAAAGGCGGCAAACAAGAAAGCCGCCGAT	431415
431416	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GCTCAATGCAACAGGGTGGAGCGCGTACACGACAA	431480
431481	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TATATCAACGCCCGCGTCCTCCCTGCCCTCTACATGA	431547
431548	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GTATTTGAAAACAAAAAAACATGCCCGGAATTTGAC	431613
431614	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GATGTGACCGACTCATATAAGGGTTTCTTGGAGAAA	431679
431680	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TAGCTTATGATGAGAATAACCTAATGAGCGTATGCA	431745
431746	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AGGCTTTGTTGCTGCTGAGTTTTATGACCAGAATCT	431811
431812	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTTAATGAGCTACACTCCAATATAGAGATAGAAG	431875
431876	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TAGAGGGTCTTCTACTTCTCCACTAGTAAGACTAC	431940
431941	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	TTGAACAAACTCTCCGTCCTCTTCTATCTCTATAT	432005
432006	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	GAAGTTTATTATGCCACTTAGTTTATCTTGAATTTG	432071
432072	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	CATGTAAGGAGTGCTATTATTCCCCACGACTGAAAC	432137
432138	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT	AGCCCAGCCCCACTCAAAAGTAACTCCAGAATTAA	432202
432203	GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT		432232

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_Crispr_3

CRISPR start position : 1508187 ---------- CRISPR end position : 1508812 ---------- CRISPR length : 625
DR consensus : ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC
DR length : 30 Number of spacers : 9

1508187	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	ATTGTGACACGGGATTTTTTCATATAAAAGCTTGCG	1508252
1508253	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GCCCTTGTCGTCAGAGAGTCTGTATGTGAAAGTGTAA	1508319
1508320	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	CGAAGCAATCGAGAAGCTGAAAGAGATCATGCCT	1508383
1508384	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GGACATTGTACTGCTGAATAACAACTACGACTCGGT	1508449
1508450	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	TCGTTTGGTACGCGGGATACAGCTGATCCCCGATGC	1508515
1508516	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	TCCCCGCGGGGGTGGCGGTGCAATGGATAACGAGGT	1508581
1508582	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GGAATACCCCGAGCTCGTGACGCTCGCGGAGCTGG	1508646
1508647	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	AGCAGCTCAAAGACCTGCAGAAAGGGGCCGCTATCGAT	1508714
1508715	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GTTGCAGAAGCTATCTGTAACCGGCTTGGGTGCGGTA	1508781
1508782	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC		1508812

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_Crispr_4

CRISPR start position : 1508919 ---------- CRISPR end position : 1509926 ---------- CRISPR length : 1007
DR consensus : ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC
DR length : 30 Number of spacers : 15

1508919	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	AACTAACGCCGGTATGTTCGTTTCTAATTTAGAAA	1508983
1508984	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GATGTGGTGGCAGACTTCACAAACATGCCATATCCT	1509049
1509050	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	ATGCTGCCACGCCGTTAGCCTGTTTACCTCTCTT	1509113
1509114	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	TCGGATGAAGATCTTGTATTGAAAGCGTGGCTGGAT	1509179
1509180	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	TTAATTCTGGAGTTACTTTTGAGTGGGGCTGGGCT	1509244
1509245	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GTTTCAGTCGTGGGGAATAATAGCACTCCTTACATG	1509310
1509311	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	CAAATTCAAGATAAACTAAGTGGCATAATAAACTTC	1509376
1509377	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	ATATAGAGATAGAAGAGGACGGAGAGTTTGTTCAA	1509441
1509442	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	GTAGTCTTACTAGTGGAGAAGTAGAAGACCCTCTA	1509506
1509507	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	CTTCTATCTCTATATTGGAGTGTAGCTCATTAAA	1509570
1509571	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	AGGCTGAAGGAACTGAGGTAGGCTTCTCGTGGAAGT	1509636
1509637	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	TGATTCTTATACGAGAATCGAAGCAGAGGCGGAC	1509700
1509701	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	AAAATCTCGAAGAGGCTCTACGTATAACCCGTGTC	1509765
1509766	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	ACCCTTTTCTCCCTCGAATCTTTTTTTGAACTCTT	1509830
1509831	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC	TCGGATGAAGATCTTGTATTGAAAGCGTGGCTGGAT	1509896
1509897	ATTTCAATTGCACCATACAGGAATTAAAAC		1509926

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_Crispr_7

CRISPR start position : 2007555 ---------- CRISPR end position : 2007920 ---------- CRISPR length : 365
DR consensus : GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC
DR length : 36 Number of spacers : 5

2007555	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC	AGTATCTATTGTAACTTCAGTTAGTTTATA	2007620
2007621	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC	GGACAATCTATCGGGATTAAGTTACCTGT	2007685
2007686	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC	AGTATCTATTGTAACTTCAGTTAGTTTATA	2007751
2007752	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC	CTCATTTGTTTTTCTTGAGTCGTTTTGAGCG	2007818
2007819	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC	AAGAAAAGAGAAGAAGTGAAATTCTACGGC	2007884
2007885	GTTGGATCTACCCTCTATTCGAAGGGTACACACAAC		2007920

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_Crispr_8

CRISPR start position : 2182670 ---------- CRISPR end position : 2182966 ---------- CRISPR length : 296
DR consensus : GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC
DR length : 32 Number of spacers : 4

2182670	GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC	CAACACTAAAAAAGATCTTGGTGTTAATGATGCA	2182735
2182736	GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC	CAACCAACGAAAACAGATATGAACACTTATGCAA	2182801
2182802	GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC	CAACTCCCAACAAGGACAATTGTTCGGAAATATC	2182867
2182868	GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC	CAACTGTATTAAACTTATAGATCCTATAGAATTA	2182933
2182934	GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC		2182966

Display spacers	Crispr Properties

CRISPR id : tmp_1_Crispr_9

CRISPR start position : 2183063 ---------- CRISPR end position : 2183358 ---------- CRISPR length : 295
DR consensus : GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC
DR length : 32 Number of spacers : 4

2183063	NNNGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC	CAACTATTGTGCTAAATATTTAAGAAACAGATAT	2183128
2183129	GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC	CAACTCCCAACAAGGACAATTGTTCGGAAATATC	2183194
2183195	GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC	CAACACTAAAACTGTCAGGTATAGGAGTGGTATA	2183260
2183261	GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC	CAACTTATTCTCGGTTTTGAAGATATAACCGATA	2183326
2183327	GTTGTCTCCACCCTTCTAACTAAGGGTATTCC		2183358

Display spacers	Crispr Properties

1709645	CACCACGATGAGAAGAATAGAATTGTAAGCAA	TCCTCCACGATCTCGGTGTCTGATCTGCTTTTT	1709709
1709710	CACCACGATGAGAAGAATAGAATTGTAAGCAA		1709741

1806396	TTTAGGCCTTATATAAACGGATTCGAAG	TAGTATTCGGTCGTTTCTTGGGCGTGCTTAATGTCTA	1806460
1806461	TTTAGGCCTTATATAAACGGATTCGAAG		1806488